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多顺反子能和核糖体小亚基上的16srrna的3端富含嘧啶核苷酸的区域配对结合,有助于带有甲酰甲硫氨酸的起始trna识别mrna上的起始密码(aug),使肽链合成从此开始。
这段顺序是1974年由j.夏因和l.达尔加诺发现的,所以称为sd顺序,也称核糖体结合部位。
原核生物mrna的编码区一般编码几种功能上相关联的蛋白质,两种蛋白质的编码区之间常有一小段不翻译的顺序,叫做间隔区。
有的噬菌体rna中2个相邻的顺反子共用一段相同的编码顺序,例如,m噬菌体rna中的溶菌蛋白编码区共225个核苷酸中有189个核苷酸是由相邻两个蛋白质共用的。
原核mrna与真核mrna一样使用同一套三联体密码子(真核生物线粒体mrna有例外)。
原核生物合成氨基酸的操纵子mrna的5端前导顺序上有一段顺序称作弱化子。
弱化子具有两种可以互变的构象,其中一种构象是转录终止的信号,能使转录中止(或衰减)。
衰减调节是原核生物合成氨基酸的调控方式之一。
真核生物mrna(细胞质中的)一般由5端帽子结构、5端不翻译区、翻译区(编码区多顺反子
多顺反子)、3端不翻译区和3端聚腺苷酸尾巴构成。
分子中除g构成帽子外,常含有其他修饰核苷酸,如a等。
5端帽子结构通常有3种类型,即:g(5)ppp(5)n;g(5)ppp(5)n和g(5)ppp(5)n。
图1b[真核生物mrna结构示意图b5端帽子结构式,表示碱基,表示碱基是帽子的化学结构,n右边的m代表核糖2位羟基的甲基化。
真核细胞线粒体中的mrna无帽子结构。
一般认为帽子的功能与翻译的启动有关。
许多真核生物mrna(如珠蛋白mrna)除去帽子后翻译效率大大降低。
5端不翻译区。
也叫前导顺序。
不同的真核mrna的前导顺序长度不同,有的只有10个核苷酸,有的则有200个核苷酸。
与原核mrna相似。
真核mrna5端不翻译区中常有一段顺序与核糖体小亚基上的18srrna的3端的一段顺序互补并结合,这种结合与真核mrna的翻译启动有关。
翻译区(编码区)使用的密码子除线粒体(如人、牛和酵母线粒体)外与原核生物mrna是一样的。
真核生物mrna的起始密码子都是aug。
真核和原核生物mrna使用的密码子也都有‘简并现象‘。
即几种不同的密码子翻译出同一种氨基酸,但不同的mrna中简并密码子的利用率是不同的,真核与原核生物之间的差别就更大。
mrna的终止密码子有3个(uag、uga和uaa),其功能是停止翻译,一般只用一个终止密码子就能使翻译停止。
有的mrna有2个连续的终止密码子(见)。
3端不翻译区的长短在不同的mrna上有所不同,β珠蛋白mrna只有39个核苷酸,而卵白蛋白mrna则有637个核苷酸。
真核生物mrna3端不翻译区常有aauaa(a)或auuua(a)等顺序,它们和识别多聚a聚合酶及装配多聚a尾巴有关。
除个别组蛋白mrna外。
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